일반적으로 수막구균 감염은 단순히 급성 인두염을 일으키거나 불현성 점막감염으로 그칠때가 많음
급성수막구균혈증이 생기면 발열, 근육통, 관절통 등이 나타나고, 두통, 위장관 증상이 동반될 수 있음 수시간 내지 수일내에 발진 점상 출혈이 나타나서 저혈압, 범발성 혈관내 응고(DIC) 핍뇨, 혼수로 진행되는 전격형(fulminant)의 경과를 밟을 수도 있으며, 뇌수막염, 심내막염, 심근염, 심외막염, 관절염, 안구염 등 여러 부위의 국소 감염증을 일으키는 수가 있음